文摘
尽管近50年以来的引入对公开治疗药物,结核分枝杆菌继续施加巨大的影响世界卫生,和结核病仍然是世界上主要死亡原因是由于一个传染病。这刺激研究努力寻找新的工具来解决持续的结核病流行。
迄今为止为数不多的成功一直是一个新学科的发展,分子流行病学。这进一步增加了一个维度的古典流行病学结核和增强的了解结核分枝杆菌继续成功地在人群传播。在这个过程中,在结核病控制规划已确定不足,帮助改善积累资源。
其他技术,基于知识的完整基因组序列结核分枝杆菌,这将为探索结核病的流行病学提供新的工具,现在新兴。尽管这些进步,肺结核仍然保持毁灭性传染病,不成比例的影响在世界最贫穷的国家。
分子流行病学的未来的挑战是提供更好的理解结核病的传播动力学在这些设置和刺激在全球范围内实施控制措施。
结核分枝杆菌是人类历史上最成功的致病菌。尽管公开药物已经用于近50年,结核分枝杆菌继续发挥巨大的影响世界卫生(图1⇓)。三分之一至一半的世界人口是感染结核分枝杆菌。每年,由于肺结核有∼200万人死亡,使结核病死亡率的全球领先的原因是因为一个传染病2。肺结核是死亡的第一原因在人类免疫缺陷病毒(HIV)来华的个人(图1 b⇓)2。1999年,全球有840万例报道,2005年,世界卫生组织项目1020万例新病例的发生率1。这种增加的发病率将主要发生在非洲和亚洲国家,在与艾滋病毒合并感染的患病率最高结核分枝杆菌发生。这种病原协同作用对经济的影响特别大,因为艾滋病毒不成比例地影响人在他们的生活最丰富的阶段。
肺结核(TB)的发生率)估计全球每100000人口。□:< 10;▒;10 - 24;░:25-49;▓:50 - 99;×:100 - 300;⇔:> 300。b)估计全球人类免疫缺陷病毒(HIV)阳性的结核病发病率每100100人口:< 0.1;⋄:0.1 - -0.9; ♦: 1–9.9; ▵: 10–99; ▴: 100–249; ─: >249; □: no data. The data are for 1999 and are an estimate based on the reported incidence of TB and HIV for each country. The incidence of TB has been rising sharply in African countries with the spread of HIV, and in Eastern Europe following the break-up of the former USSR. There have also been some successes in TB control, which have probably reduced incidence, notably in Peru and China, in comparison with previous years. Modified from1。
结核病全球复苏的新的兴趣了解这种病的流行病学和发病机理。领域的一个重要进步结核病研究的分子技术的发展允许个别菌株的识别和跟踪结核分枝杆菌。这个新学科,结核病的分子流行病学,开始与识别6110年小说分枝杆菌插入序列,形成可复制的基因分型技术的基础结核分枝杆菌。这个方法现在已经牢固确立,但仍然昂贵,劳动密集型且仅适用于使用可行的文化材料。虽然其他输入方法,在不同的发展阶段,提供一定的优势出现在再现性、成本、易于执行和一般适用于临床的设置,6110年基于输入仍是国际公认的标准和继续提供新的见解的流行病学结核分枝杆菌。
一个新的研究方法,由完整的基因组序列的测定结核分枝杆菌是把这些传统的分子流行病学技术与分枝杆菌基因组学的发展3。输入技术的目标是使用数组现在用于个别菌株的鉴定或克隆菌株与特定的表型特征分组,如遗传性、抗原性或抵抗抗菌药物。这些菌株可以进行全基因组分析,使用技术,如微阵列表达分析或基因缺失检测,以确定这些重要的表型性状的遗传基础。这种多学科的方法可能导致重要的进步在理解人类结核病的发病机理以及耐药性的机制。
分子流行病学标记
分子分型方法的引入,之前几乎没有帮助个别菌株之间的区别结核分枝杆菌。药敏模式被使用,但有限的效用,因为模式可以在大多数人口变化和电阻是罕见的。打字的可变性对分枝杆菌噬菌体感染的易感性也被使用,但发现很难繁殖,可用噬菌体的数量有限。分子分型方法的发展和应用,如限制片段长度多态性(RFLP)分析基于插入序列6110年在1990年代给研究带来了一个新的维度的结核病和生态复杂性的新的认识古典流行病学无法提供。是6110年是最广泛研究和广泛使用的已知插入序列,尽管的可用性结核分枝杆菌基因组序列已经导致> 30个额外的重复元素的鉴定承诺是有用的类型标记4。本文综述最常用的输入方法,新方法和应用这些技术在结核病的研究。
是6110年限制片段长度多态性
是6110年在1989年最初描述5。这个标志由1355个碱基对,属于3插入序列的家庭。是6110年有两个开放阅读框编码转换所需的蛋白质。副本的数量6110年0-25范围,他们的立场的结核分枝杆菌染色体高度变量不同分离株(图。2⇓)7。这种变化足以产生RFLP和用于指纹。是6110年只出现在吗结核分枝杆菌复杂的物种,尽管菌株结核分枝杆菌缺乏该元素也被描述8- - - - - -11。是6110年序列的非随机分布,表明插入热点。其中之一是一个区域两侧直接重复序列(博士)12。的非随机分布6110年在基因组是现在被认为是一个限制的辨别力输入基于这个序列的拷贝数和位置。
是6110年基于双脱氧核糖核酸指纹结核分枝杆菌分离出结核性疾病的患者从10两集。分离到的车道1 a-10a:在结核病的第一集;从第二集车道1 b-10b:隔离;巷11:m . avium(一个分枝杆菌物种没有副本的插入序列6110年);巷12:H37Rv (结核分枝杆菌参考应变)。标准标记的大小。)双隔离与相同的限制性片段长度多态性(rflp),表明这些病人经历了内生复活(复发)相同的应变在第一集疾病。b)对与不恒等的rflp,表明外源性再感染有不同的压力。kb:千碱基。修改后的6。
是6110年的类型是应用最广泛的基因的分子流行病学方法结核分枝杆菌的黄金标准,是目前其他方法比较13。标准化的各种重要因素已确定M。肺结核遗传指纹分析,包括使用限制性内切酶变形杆菌属寻常的二脱氧核糖核酸(DNA)消化和分子量标准的公司带大小的估计。这个标准化促进了比较获得的指纹在不同世界各地的实验室,让紧张的全球传播被跟踪。例如HIV-seropositive发达原发性肺结核病人从一个耐多药结核病(mdr - tb)菌株在旧金山,CA,美国,它被发现是一个独特的本地数据库中指纹。进一步审问,住院病人透露说,他已经在布宜诺斯艾利斯,阿根廷,前一年,期间的报道耐多药结核病的大爆发14。旧金山菌株被发现有一个相同的6110年布宜诺斯艾利斯RFLP图案和抗生素耐药性的菌株,展示个人的地理范围结核分枝杆菌可以传播。与HIV-seropositive患者发生了类似的情况,开发了结核病在荷兰获得结核显示曝光后在医院在西班牙15。标准化方法和集中的数据库成为可能证实这些患者获得感染,而在国外,而不是在他们居住的地方。
虽然副本的数量6110年不等0-25、以人群为基础的分子流行病学研究报告,8 - 18份,大多数菌株包含许多足以使大多数菌株之间的歧视。例如来自旧金山的数据显示,9岁的1800名患者在一段时间内,有1117(62.2%)明显的DNA指纹在171年和683年(37.9%)集群共享相同的模式。不到1%的菌株鉴定有两个或更少的乐队11。然而,在亚洲和非洲有地理区域的多样性6110年会大大减少8- - - - - -10,16,17。此外,更多的是6110年发现了bandless菌株在亚洲7,8。缺乏相关的多态性较低的副本数量限制了歧视性的权力和流行病学的推论,可以用这个打字方法。然而,额外的或次要输入系统可用于区分菌株与一些副本10,18- - - - - -22。
遗传标记的一个重要特征是它的稳定性。标记的变化过快的流行病学联系,而那些太稳定推断不存在直接联系。理解的速度和决定因素6110年模式变化因此重要指纹的最佳诠释。一项研究发现,分离的条带模式收集≥90天除了相同的病人在29%的情况下是不同的23。在荷兰,变化的半衰期6110年估计是3.2年24。有趣的是,大量的串行通道的压力在体外,比如卡介苗疫苗(减毒结核病疫苗)或结核分枝杆菌紧张,不与这种快速变化有关RFLP指纹档案10,25。是可能的,因此,研究涉及连续分泌腺高估的变化率或复制在一个主机可以引发6110年换位。
二次标记
经验证据表明,流行病学的确定性之间的链接可以推断病人感染结核分枝杆菌如果涉及的菌株产量明显减少小于56110年组合乐队,但是可以提高使用额外的标记18- - - - - -20.,26- - - - - -29日。因此基因分型结果与第二个标记是至关重要的决定发生在这些情况下传播。两种技术,多态guanine-cytosine-rich重复序列(pgr)分析和spoligotyping,一直是最广泛用于此目的。
多态guanine-cytosine-rich重复序列限制片段长度多态性打字
pgr的身份出现在多个染色体集群30.- - - - - -32使发展的第二个RFLP输入系统。这已被证明有歧视性的实力接近6110年打字,即使在较低的隔离副本的数量6110年,使它理想的二次输入系统21,26,27,33。然而,pgr区域包括许多非完备重复,使RFLP模式复杂,有时难以理解。最初,这些被认为是重复序列非编码,但分析的结核分枝杆菌基因组已经建立了,他们代码的C末端应承担的小说类未知蛋白质的功能。
Spoligotyping
使用DNA RFLP分析来区分的结核分枝杆菌是这个有机体阻碍了文化的需要。是6110年RFLP分析也是技术上的要求和昂贵的,需要昂贵的计算机软件指纹的解释和比较。相反,聚合酶链反应(PCR)的方法需要很少量的DNA,可以不通过细菌培养获得。此外,PCR可以直接进行临床标本,使同时识别和应变类型结核分枝杆菌患者的痰34- - - - - -44。
Spoligotyping质问一个重复序列组成博士36-base-pair元素隔开nonrepetitive短序列,就是这样一个pcr技术30.,39。使用一套引物,它可以同时放大所有的独特nonrepetitive序列,或间隔之间的直接重复。然后确定间距器的存在与否通过南方的杂交。个别菌株区分间距器的数量缺少完整的间隔设置定义为从大量的测序这个地区结核分枝杆菌菌株。
Spoligotyping已被证明是有用的分离株之间的差别结核分枝杆菌与几6110年乐队40,42。分析了非典型分枝杆菌菌株使用spoligotyping和不给一个信号,表明这种方法的特异性结核分枝杆菌42。执行直接spoligotyping痰样本的能力使它适用于急性临床情况39,45。这种辅助标记技术的另一个优点是它经济、易于执行和快速的输入方式结核分枝杆菌复杂。这些特点使它成为一个候选人在资源贫乏的情况下使用。然而,这种方法的歧视性的力量是不足的6110年打字40,46- - - - - -48。自结核分枝杆菌隔离不同spoligotype总是有区分6110年概要文件,spoligotyping可能作为初步筛选步骤之前应用二次大歧视性的技术力量42,47,48。
分枝杆菌点缀的重复单元数量可变串联重复序列和其他聚合酶链反应技术
各种pcr技术类型结核分枝杆菌隔离了。在最近的一次多个实验室的比较研究中,六个这样的技术比较的歧视性的权力和再现性46。这些技术很容易和快速执行但只有他们两个,mixed-linker PCR和串联重复序列的变量数量(VNTR)足够可再生的方法44,49。然而,这两种技巧,只有mixed-linker PCR相媲美6110年打字的歧视性的权力。不幸的是,mixed-linker PCR技术,取决于是也6110年生成的多态性,因此是有限的使用在low-band-number隔离。这也是另一个前景看好的情况下6110年基于PCR技术,ligation-mediated PCR46。
更有前途的方法来开发一个pcr打字系统识别小说多态位点,是独立于现有的技术,如6110年打字。分枝杆菌点缀的重复单位(MIRUs)这些元素的一个例子50- - - - - -52。他们是一个特定类的VNTR已确定在41个不同位点的基因组结核分枝杆菌。短的重复序列的每个包含字符串(< 100个碱基对)。重复的数量在不同的位点不同菌株之间。在每个MIRU PCR扩增,因此,不同菌株产生不同大小的碎片。如果这些碎片是准确的尺寸,重复在每个位点的数量可以确定。分析12最高变的位点导致的歧视权力接近6110年打字。这种方法尤其适合使用全球数据库为每个类型的应变分配一个12位数对应的数量在每个MIRU轨迹重复53。这种明确的编码系统使得多个实验室的比较肤浅。MIRU打字的主要限制是技术性的困难与准确分级多个小PCR碎片。这可以在一定程度上克服多重PCR结合荧光技术DNA分析仪52。
分子标记和系统发生学
大多数尝试开发打字技术研究结核病已经针对个别菌株的区分结核分枝杆菌为了定义传播链。遗传机制,这种技术需要高度多态,随着分子时钟,快速生成足够的多样性在菌株。然而,这些技术并不是特别适合研究更远亲菌株之间的系统发育关系。例如是6110年拷贝数没有关系发展史的多样化结核分枝杆菌根据管家基因单核苷酸多态性54。定义这些系统发育关系的兴趣最近开发的识别组压力密切相关,如北京家庭(见下文),似乎有一个特定的表型。
删除分析是一个特别有吸引力的方法研究的发展史结核分枝杆菌压力,因为它能同时提供一个独特的生物学基础的信息菌株表型55。本质上,一株的基因组评估使用微阵列来确定是否删除发生相对于测序参考应变。因为这些删除很少出现在完全相同的染色体位点独立,他们可以被看作是独特的和不可逆转的基因事件。这些缺失的数量和分布,因此,提供了一个基因签名,可以用于构建健壮的系统发育关系。这些缺失破坏编码区域的基因组和人们很容易推测特定基因的丧失可能会影响菌株如遗传性或抗原性的重要特征3,56。
分子流行病学的教训
在人群传播动力学
分子流行病学调查非常有用在提供结核病的传播动力学的理解在一个社区。这些研究是基于这样一个前提:病人感染菌株显示相同的指纹,称为“集群案例”,是最近传播的结果,而感染分离株具有独特的RFLP模式假定的代表菌株获得的远程传输,从而激活更遥远的过去。
更可靠的分子流行病学工具的可用性之前,这样的信念是,10%的患者结核分枝杆菌由于最近的传播疾病。然而,以人群为基础的分子流行病学研究在旧金山,(美国CA)、纽约(美国纽约)和阿姆斯特丹(荷兰),改进对这个主题的理解。这些研究表明,最近感染的速度远高于传统流行病学研究预测的约10%。例如,在旧金山,几乎三分之一的新结核病例由于近期感染。在纽约,聚类估计是40%,在阿姆斯特丹,47%57- - - - - -59。在旧金山,一个病人被发现指示病例,占6%的新病例的结核病的传播期间1991 - 1992。在这些研究中,与最近的传输相关的危险因素是降低社会经济团体,本地少数民族和获得性免疫缺陷综合症。这些研究对结核病控制有重要影响。他们证明,持续感染的传播造成的疾病负担更高的利率比此前认为的,并强调了在中断传输控制工作的重要性,特别是在高危组。
挪威和瑞士以人群为基础的研究显示比例相对较低的聚类(16 17.5%)相比,其他的研究60,61年。这最近的低水平的传播表明,结核病控制在这些设置更有效。RFLP指纹识别的研究中,因此,可以作为一个工具来监测结核病控制项目的性能。此外,这种类型的研究可以用来识别特定结核病传播的危险因素和协助目标干预的亚种群比例导致传播。例如,在旧金山,加强结核病控制的整体数量减少那些近期感染62年但还演示了持久difficult-to-target高危人群中传播。
聚类的一般原则6110年模式相当于与最近传输可能并不适用于所有情况。例如,研究表明,聚类的速度取决于研究下的面积。在资源贫乏的国家,集群的14 - 41%被发现9,29日,63年- - - - - -66年。这些结果出乎意料,因为这些研究集群的利率相当于或低于国家发生率低。在这些发病率较高的地区,结核病控制较差,预计更多的传播。然而,大多数这些研究不报告肺结核的发病率,而且,在许多情况下,很难确定样本的百分比分析研究那些可用的社区。这尤其重要,因为隔离取样的数量研究可能在比较小的总数循环分离导致传输。由于取样的程度影响集群,传播的速度可能被严重低估了67年,68年。因此,当务之急是,在社区研究,包括高百分比的循环分离,以准确确定最近的利率和再活化的疾病。
流行病学亚种群对结核病传播的影响
移民亚种群的影响在结核病流行病学的一个社区的人口被认为是发达国家的一个重要的公共卫生问题。例如,在1986 - 1997年诊断结核病病例的数量在外国出生的人在美国增加了56%。这些统计数据表明,移民可以传播肺结核土著人口。然而,在一项研究中,只有一个43例在移民导致继发性肺结核病例感染两个在美国出生的情况下。另外五分之一的在旧金山出生在墨西哥的患者获得结核感染69年。这项研究特别重要,因为土著居民被证明传播肺结核以更高的速度比移民移民原住民。同一个城市的一项研究描述了两个平行的外籍和出生于人口结核病的流行病学模式70年。大多数外籍个人开发结核病从复活,而出生于开发结核病从近期感染病例的20%。在其他环境中,描述了不同的传播模式在移民人口。结核病的传播已经从丹麦的移民记录71年,72年。最近在荷兰,几乎一半的传播发生在移民群体,但是大部分的传播发生在同一国籍73年。
传播指数,定义为结核病例的平均数量造成最近传播的潜在来源的情况下,被用来量化传输之间不同的亚种73年。在旧金山,传播指数被发现在外国出生低于出生于病人和更高的美国黑人患者的< 35岁74年。这些研究表明,定义不同人群之间传播的性质可以用来通知,加强结核病控制。
流行病学怀疑和未知的传播
除了上述研究,分子流行病学在其他方面有助于改善疾病控制。例如一项研究证明了爆炸性的肺结核疾病进展的潜力和传播感染艾滋病毒的人75年。在这项研究中,传统的监控检测12例肺结核的居住设施与艾滋病人。分析是隔离的6110年RFLP证明新感染结核性传播感染艾滋病毒的患者容易暴露在疾病的进展在3个月内,展示了特定漏洞的外生肺结核感染的感染艾滋病毒的人。
分子流行病学也已记载了潜在的住院患者耐药菌株的传播14,76年- - - - - -79年。在一个时期,43个月纽约占了几乎四分之一的美国耐多药结核病例。大多数的患者感染艾滋病毒和被发现拥有了他们致命的耐多药结核病而住院80年。这和其他类似研究的结果导致更严格的坚持感染控制政策,特别是在设置中有许多感染艾滋病毒的人81年。增加监控与及时诊断和适当的治疗设置如医院、监狱、学校和无家可归者收容所现在总的结果减少结核病的传播81年。
以人群为基础的分子类型的研究也显示出巨大的影响,一个人或一小群人对结核病传播。在明尼阿波利斯(美国MN),在1992年,一个人被证明导致所有新活动性肺结核病例的35%80年。第一个大规模的分子流行病学研究发现广泛的传播结核分枝杆菌一小群物质滥用者中重要的“溢出效应”82年。知识管理不善的负面影响病人在社区强调需要一个持续的结核病控制每一个疾病的情况。
积极发现病例,通过评估个体的接触传染性肺结核病人,是一个工业化国家结核病控制规划的传统活动。这一政策的基本原则是,接触很可能已经感染了传染性病例,因此携带相同的应变(用同样的药敏模式)的索引。这个假设是测试指数和接触情况下的研究83年。作者比较了DNA指纹的双索引和联系人都最终被诊断为肺结核。54百分之三十(16)对有不同的指纹,证明接触被感染的一个身份不明的第三人。这说明传输链接往往是更复杂的比传统认为的流行病学。同样,五大集群之间的联系的调查在荷兰显示传输发生后只有短暂的接触,与传统观点相反,肺结核通常是获得长期接触后感染情况84年。这种复杂性也在以人群为基础的分子研究。例如经常很难建立一个个案之间的流行病学联系在一个RFLP集群。指纹识别和联系调查在不同设置了只有5 - 10%的病例流行病学联系58- - - - - -60,84年。
相同的指纹并不总是与一个建立流行病学联系。例如菌株从农村地区患者地理上分散的,不太可能有之前联系被发现有相同的指纹33。同时,压力的情况下在不同的州在美国被发现是相同的,虽然他们没有以前的历史联系26。同样,在南非、坦桑尼亚、津巴布韦、肯尼亚和马拉维、菌株不同分散的地理区域有相同的模式85年。这些研究表明,一些菌株比其他人更为普遍和丰富,这可能会导致流行病学张冠李戴的链接。因此,应注意达到结论完全基于相同的指纹结果。
分子流行病学研究的解释应该很大程度上取决于研究问题,研究和输入方法下的面积。打字方法基于更快速和慢分子时钟,原则上,能够区分远程和最近的传播聚类的贡献。打字方法可靠地缓慢分子钟可能是非常有用的在全球跟踪和肺结核的进化研究。因此,未来的挑战是与不同的分子时钟,可以识别识别技术,与确定性,最近的和远程的进化压力之间的联系。
水平的量化涂阴病人的传染性
人们普遍认为,结核病患者的痰液显微镜检查未能检测到抗酸的细菌感染(AFB)明显低于那些积极的涂片。然而,分子流行病学研究,相比传播从空军基地涂阴病人痰检阳性和消极的患者建议空军基地负责≥21%的结核病传播的旧金山86年。因此加强涂阴肺结核控制措施情况下可以显著降低结核病的传播。
目前感兴趣的话题
北京基因型流行病学流行
一个不同的家庭结核分枝杆菌菌株(后来被贴上“W应变”)与在纽约和> 350例病例中,一度在美国占所有耐多药结核病例的25%97年。这些菌株后来被证实属于一个不同的家庭的一个分支的菌株命名为“北京基因型”,因为他们在中国的北京地区的优势。虽然是6110年北京株RFLP图案并不是唯一的,通常是难以区分从其他基因型,spoligotype非常独特的和容易识别。使用spoligotyping,北京株与传播有关在阿塞拜疆,泰国、爱沙尼亚、伊朗、越南、马来西亚、爱沙尼亚、中国、香港、南非、哥伦比亚和俄罗斯48,98年- - - - - -103年。它的存在已经检测到整个东南亚和香港,北京,在一个领域的研究中,基因型家庭占所有的70%隔离104年。
大加那利岛,岛上的这个基因最初是由一个从非洲移民。在一段4年推出后,这个基因型成为岛上最常见的隔离105年。在世界的一些地区,这一毒株与案件有关结核病的年轻的人48,106年。协会的这个基因型与年轻组是公认的正在进行的传输。此外,研究发现之间的显著相关性北京基因型和耐药性97年,103年,107年。这一毒株的全球传播和明显的遗传性了诱人的可能性,这些流行病学特征反映了这个家庭所特有的一种内在的生物属性。还假定,如果这些菌株确实可以更有效地复制主机,这可能有利于发展的阻力105年。正在深入研究指向阐明这种明显的表型的遗传基础。然而,这个家族还有待观察是否菌株毒力更强,其作用可能在全球结核病疫情。
外源性再感染的流行病学证据
直到分子指纹技术成为可用,外源性再感染现象证明发生。评估艾滋病病毒感染者在纽约的一家医院,他反复产生了积极的文化结核分枝杆菌,确定11顺序隔离患者,成为抗菌药物耐药。在这四个病人,隔离的RFLP模式发生了巨大的变化,耐药性检测。在这些患者,临床和微生物证据符合活动性结核病的存在引起的新菌株结核分枝杆菌107年。外源性再感染的人只有immunosuppressing条件糖尿病也得到了证实108年。
在非洲的一项小型研究显示患者的重要性考虑再感染结核病的历史。原始和结核复发性隔离分析五个病人在这项研究中被认为是艾滋病毒阳性结核复发109年。再感染了一个病人的原始和复发性隔离有显著不同的指纹。这项研究表明,当肺结核反复出现在艾滋病患者标准治疗后,再感染新的隔离并不仅应考虑复发。
高发病率的设置,尤其是那些高艾滋病毒合并感染、预计再次感染是很重要的。这是在在南非进行的一项研究中,多达75% 16(12)的患者有不同的指纹在他们最初的疾病和第二集110年。然而,在南非矿商进行的另一项研究中,只有2%(1 48)的病例被发现是由于再感染109年。在香港的其他研究8和印度111年报道的再感染12 - 31%不等。在这些研究中,不同的方法和可能的污染占差异结果。因此,很难得出明确的结论,再感染的速度高发病率国家基于这些研究。
在大加那利岛岛上的一项研究中,西班牙,在一个设定好的结核病控制措施,并结合细致的方法,44%的18)(8例归因于再感染。因此,即使在社区结核病的发病率低,再感染似乎是重要的112年。
准确地建立再感染的比率在不同的设置是很重要的,在预测控制策略的影响,如直接观察治疗,短期课程(点),在当前结核病流行的进程。例如,如果点迅速关闭了传输和再感染很少见,疫情将慢慢死亡,因为通过激活情况下将继续出现。相反,如果复活并不常见,疫情将下降相对快速点防止新病例通过停止再感染。此外,利率的确定再感染与复活在高水平的艾滋病毒合并感染的地区是至关重要的设计最合适的chemoprophylactic策略。例如,在一个区域与高水平的外源性再感染,短期价值的化学预防不太可能。
isoniazid-resistant菌株的相对健康
耐多药结核病的发展和传播,定义为至少耐异烟肼和利福平,尤为令人担忧,因为它需要长时间的昂贵的治疗,通常只会产生低治愈率113年,114年。尽管对耐药结核病的传播,对耐药菌株的传播能力,生存和繁殖的人口比敏感菌株115年。
实验模型表明,抗生素耐药性细菌健身上强加一个生物的成本116年,117年。人们认为抵抗的机制,例如异烟肼(突变katG基因),导致一个内在的健康成本微生物产生115年。这是支持的在体外研究表明katG需要优化的生存吗结核分枝杆菌在动物模型118年。
额外的证据表明,耐药菌株不太适合来自荷兰进行分子流行病学研究墨西哥和南非,少集群观察耐药菌株之一84年,109年,119年。在集群的一个更深入的分析在旧金山,繁殖数量的循环结核分枝杆菌菌株耐异烟肼被发现相比显著降低的情况下繁殖数量受到循环表型(数据没有显示)。这些分子流行病学研究表明,异烟肼耐药性的发展带来一个重要的生物的成本结核分枝杆菌。这降低了健身能削弱isoniazid-resistant结核病和耐多药结核病的流行病学影响表型的人口。然而,这还有待观察健身成本的大小可以克服勾结的许多因素促进耐药结核病的传播在社区结核病高负担。
结论
分子工具的发展添加了一个新维度的古典流行病学结核和极大地增强了理解的复杂动力学在人口和主机之间的传播。在这个过程中,分子流行病学已经证明不足在结核病控制规划和帮助积累的动力和资源为他们的进步。其他技术基于知识的完整基因组序列结核分枝杆菌,这将为探索结核病的流行病学提供新的工具,现在新兴。尽管最近的研究进展,肺结核仍然保持毁灭性传染病,不成比例的影响在世界最贫穷的国家。分子流行病学的未来的挑战是提供更好的理解在这些国家结核病的传输动态最大的疾病负担,并刺激迫切需要改进控制措施在全球范围内。
- 收到了2002年2月14日。
- 接受2002年3月13日。
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