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描述为“成功”的模板,Hanekomet al。(1北京基因型结核分枝杆菌与hypervirulence有关、耐药性、逃税的卡介苗(BCG)疫苗和免疫调节差(1]。基因型本身是不同的;相应的具体特征相关联的事实与北京只在某些设置可能被解释为在每个亚型的变化,自成一格。
我们试图探索北京基因型的角色在耐多药肺结核(MDR)的流行病学(TB)在两个非常不同的流行病学设置:英格兰和秘鲁。在英国近四分之三的结核病发生在移民,这可能导致潜在的结核分枝杆菌从原产地高负担国家获得的感染。因此在英国血统的分布反映了复合循环压力的其他国家。同时增加水平的耐多药结核病在英国引发的担忧可以理解,只耐多药结核病例的一小部分(2011年是1.0%)2]。相比之下,秘鲁结核病疫情相对“国产”和耐药性的流行更大(2011年,5.3%的检验结果是耐多药结核病)[2]。我们的目标是:1)识别之间的任何协会北京基因型和耐多药在这两个设置,和2)检查如果趋势可以解释在北京耐多药结核的患病率随着时间的变化。
本研究期间使用的四个数据集:两个英语学习和秘鲁的两项研究。
英语从公共卫生数据集被英格兰的加强结核病监测系统和分枝杆菌监测网络,被称为英格兰英格兰1和2。英格兰1由8 859人诊断和24-loci MIRU-VNTR(分枝杆菌点缀的重复单位可变数目串联重复序列)strain-typed在2010和2011之间。其中,4 661至少有一线药物敏感性数据,最小12-loci预定义的配置文件(3)和肺。英格兰189耐多药结核病例包括从2004年到2007年,它经历了24-loci打字。117例肺,至少最小标准12-loci概要文件。24-loci打字没有可供non-MDR情况下在此期间。对利福平、异烟肼、乙胺丁醇、吡嗪酰胺、链霉素、阿米卡星、卡那霉素、卷曲霉素、阿奇霉素、克拉霉素、环丙沙星、氧氟沙星、莫西沙星、prothionamide、乙硫异烟胺、环丝氨酸、4-aminosalicylic酸,linezolid, clofazamine和利福已经测试使用比例或电阻率的方法。
秘鲁数据集被称为秘鲁秘鲁1和2。秘鲁323 sputum-positive肺结核病例,包括招募从临床设施在利马在2004年和2006年之间,从Taypeet al。(4]。229进行灵敏度检测利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素,其中101(44.1%)耐多药;我们注意到,这个数字远远高于MDR的整体比例在此设置2),这表明药敏测试优先考虑那些在MDR的风险最高,与以前的秘鲁测试政策一致。所有情况下都有一个完整的标准12-loci概要文件。秘鲁2包括230例肺耐多药结核病发现1996 - 2004年间在利马(5,6]。隔离进行了药敏检测利福平、异烟肼、乙胺丁醇、吡嗪酰胺、链霉素、卡那霉素、卷曲霉素、乙硫异烟胺,4-aminosalicylic酸和左氧氟沙星。一个人缺乏一个完整的标准12-loci概要文件被排除在外,229年离开。
MIRU-VNTRplus利用指定血统了所有四个数据集,以确保可比性(7]。血统和sublineage配置文件的实质性差异英语(英国4661个人)和秘鲁(秘鲁229个人)肺结核病例明显独立(卡方检验p值< 0.005)。绝大多数的秘鲁病例的欧美血统(212(92.6%)的229个),与拉丁American-Mediterranean (LAM)大多数sublineage(102(48.1%)的212个)。其余病例几乎所有北京(15(6.6%)的229个)。相反,英语情况下由各种血统的符合他们的跨国起源:欧美2412年(51.8%)的4661年,Delhi-CAS(中亚)1335 4661(28.6%),东非印度(EAI) 429(9.2%) 4661年,北京392年(8.3%)的4661个。欧美sublineages观察也不同。
限制我们的分析MDR病例显示秘鲁和英格兰之间的截然不同的配置文件(p值< 0.005)。秘鲁的情况下(秘鲁229个人)是由欧美血统(215(93.9%)的229个),其中121(56.3%)的215年林sublineage。秘鲁1的回归模型探讨耐多药和之间的关系结核分枝杆菌天堂没有协会(北京原油或(95% CI) 1.10(0.38 - -3.14),瓦尔德假定值0.86;欧美基线)。血统的总体布局,形成鲜明对比英语MDR病例(英格兰1)北京比例增加到36(47.4%)的76个。回归模型显示强阳性之间的联系北京和MDR英语肺部情况下,(原油或11.51 (6.65 - -19.95),p < 0.005;调整或9.53 (4.87 - -18.65),p < 0.005;欧美基线和英格兰1用于模型;模型排除了非- m。肺结核例和那些缺失的数据)。年龄、性别、社会风险因素综合变量(无家可归、监禁、药物/酒精滥用),出生的国家,民族和先前诊断在后者进行调整;这样做不能对秘鲁1作为这些变量并不可用。
我们还测试了北京是否丰富更多的药耐药性菌株中(图1一个)。Pre-MDR-TB (pre-MDR)被定义为抵抗,但不是两个,异烟肼和利福平。Pre-extensively耐多药耐药(pre-XDR)例+耐氟喹诺酮类或二线注射。北京从pre-MDR丰富XDR情况下英语数据(皮尔逊相关系数(p趋势)北京与non-Beijing p < 0.005;英格兰1)。这可能是专门观察中,除出生,但不是英国出生的情况下(数据未显示)。没有见过秘鲁趋势数据(p趋势= 0.76;秘鲁秘鲁1和2)。协会进一步分析以决定是否改变了随着时间的推移,表示最近增加的比例情况下由北京(p趋势< 0.005;英格兰英格兰1和2)(图1 b)。
我们的分析表明,北京基因型中扮演着不同的角色在当前英国耐多药结核病流行病学和秘鲁。在英格兰,观察协会可能反映了耐药菌株的不断上升的进口,而不是在英国的发展阻力。在秘鲁有可能同样盛行的MDR基因型中,可能解释为什么我们没有观察到一个协会。有趣的是,我最近的一篇论文wamotoet al。(8]表明,北京的总体发病率增加了在秘鲁在过去的十年里,但北京株MDR的比例已经下降。
我们利用可用数据集与变量的研究在不同的时间进行设计,因此一些解释谨慎是必需的。例如,秘鲁2招募从家庭超过一个肺MDR的案例中,因此可以采样过量聚集情况。然而,相似的谱系档案与秘鲁秘鲁2 1,而不是通过这样的方式收集,表明这种影响是有限的。英语病例检测电阻比秘鲁更广泛的药物情况下,因此,“不知道抵抗”类别并不是严格的两个数据集之间的可比性。然而,只有1.3%的英国1数据集是耐药不是秘鲁1数据集内进行测试。
分子流行病学监测和应对和预防结核病消除阻力被强调为重要的欧洲呼吸学会(188bet官网地址9,10]。我们证明在这个研究的工具如何帮助后者是至关重要的:在秘鲁MDR的流行可能会恶化应该健康北京耐药株进化或输入的国家,在英国血统概要文件是高度动态的。
确认
我们承认我们利用T的公布的数据aypeet al。[4]。我们的研究利用MIRU-VNTRplus数据库的网站(www.miru-vntrplus.org)由d . Harmsen s Niemann p供应和t .身上。
脚注
支持声明:H.R.所支持的欧洲呼吸协会奖学金STRTF 24 - 2011。188bet官网地址英语的应变类型数据集是由公共卫生英格兰的应变类型项目。即Abubakar通过NIHR高级研究奖学金资助NIHR - 2011 - 04 - 001。
利益冲突:披露可以找到与本文的在线版本www.www.qdcxjkg.com
- 收到了2013年7月3日。
- 接受2013年8月31日。
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