抽象
背景:随着RNA测序技术的出现,我们可以研究更详细的主机转录变化。这项研究的目的是为了进一步发挥该模型查询使用RNA测序的流感病毒感染人鼻上皮转录变化。
方法:我们从不同的健康供体中提取了越来越多的RNA测序样本,以建立人流感感染后的共同鼻腔特征。我们进行了差异基因分析和pathway基因集富集分析,以阐明感染后鼻上皮发生的关键变化。
结果:通过RNA测序,我们分析了鼻上皮细胞中大量显著差异表达的基因,并鉴定和验证了与人类流感感染免疫应答相关的额外转录本。免疫途径在很大程度上与病毒反应,干扰素通路,MAPK途径和NFκB途径。我们还对非免疫应答转录本进行了重点分析,以确定鼻上皮细胞(流感感染的原发部位)特有的关键非免疫通路。被发现的差异调控途径包括凋亡、脂肪酸反应和有机循环化合物代谢。
结论:总之,人流感的RNA测序分析感染鼻上皮揭示针对流感病毒感染的鼻上皮的早期应答的途径,并且可以用作一个健康的基线比较器,用于发现目标以及与流感感染比较潜在的慢性炎性气道条件。
脚注
引用本文为:《欧洲呼吸学报2019》;第54页:增刊63,PA5442。
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