TY - JOUR T1全基因组测序确定最近结核病传播的准确性:11年以人群为基础的研究在德国汉堡JF -欧洲呼吸杂志》乔和J - 10.1183/13993003.01154 -2019欧元六世- 54 - 5 SP - 1901154盟一昼夜的罗兰AU -科尔,Thomas a . AU -毛雷尔,Florian p . AU -默克,马提亚AU - Meywald沃尔特,凯伦盟——Hannemann Jorg盟——Nienhaus艾伯特AU -供应,菲利普•AU - NiemannN2 -控制人对人结核病(TB)传播是实现世界卫生组织(WHO)制定的最终结核病战略目标的关键[1,2]。遏制结核传播，特别是在大城市，是全世界具有挑战性的首要任务。由于大都市地区集中了高危人群，如无家可归者、吸毒者和经常来自(其他)结核病高发地区的移民，因此它们的结核病病例通报率高于全国其他地区。人口密度和复杂的社会相互作用放大了传播的机会，经常导致大型、临时扩展的传播网络[3]。阻断传播的针对性干预措施需要有效的结核菌株基因分型与加强流行病学调查相结合。而经典IS6110 DNA指纹技术和24-locus MIRU-VNTR(分枝杆菌点缀重复units-variable串联重复序列的数量)打字容易提供标准化和可计算的输入结果与在线系统命名法,几项研究已经表明,全基因组测序(WGS)具有优越的歧视性的权力,允许一个无与伦比的解决爆发菌株(十)。然而，相对于大多数确定性的参考文献，即在扩展的时间和人口规模中，通过特别调查确定的具体流行病学联系，WGS在大都市地区检测传播的预测能力尚未得到量化。使用5 snp c:d: utoff进行WGS分型，以最高的精度描绘了最近的传播链，并提供了高分辨率的抗性模式，从而实现了直接的临床益处http://bit。ly / 2 pk37wowe要感谢伊尔丝Radizio,凡妮莎·莫尔,挚友Niemann和茱莉亚Zallet (Borstel从研究中心、德国),技术援助,Hamburg-Central公共卫生部门的工作人员,德国和卡罗琳Allix-Beguec,西里尔发言,马蒂尔德Mairey和斯蒂芬妮Duthoy(所有Genoscreen、里尔、法国)基因组测序的帮助。 ER -